Вернуться на главную страницу > технология > обработка данных
лаборатория технология публикации новости связь с нами карта сайта
обработка данных и программное обеспечение

Обработка и анализ данных, полученных с помощью биочипов, осуществляется с помощью пакетов программ ImaGel Research и ImaGel ImageWare.

Программа ImaGel Research предоставляет пользователю наиболее развитый сервис по получению, обработке и визуализации экспериментальных данных. Применяется на стадии лабораторных исследований.

ImageWare является основной программой для конечного пользователя и входит в состав почти всех диагностических тест-систем.



ImaGel

Программное обеспечение ImaGel предназначено для регистрации, визуализации, обработки и сохранения данных, полученных с помощью CCD или видеокамер.

Базовая версия ImaGel настроена на работу со следующим оборудованием:

  • CCD-камерами фирмы Roper Scientific, www.roperscientific.com, через библиотеку Pvcam32.dll;
  • CCD-камерами предприятия ООО "Дельтатех", http://www.deltatekh.ru;
  • CCD-камерами предприятия ООО "Видеоскан", http://www.videoscan.ru;
  • позиционером Motion Controller, Model MM2000 (MM3000) фирмы Newport, http://www.newport.com;
  • термоконтроллером LFI-3500 фирмы Wavelength Electronics, Inc, http://www.wavelengthelectronics.com;
  • устройством смены фильтров.

В пакет ImaGel входят программы: ImaGel Kinetics и Calibration Curves.

ImaGel Kinetics предназначена для моделирования и обработки кинетических кривых, полученных в экспериментах на двумерных и трехмерных чипах.

Calibration Curves производит подгонку параметров экспериментальной кривой по заданной пользователем формуле. В отличие от аналогичных программ нет неоходимости задавать начальные значения параметров.



ImaGel ImageWare

Программа выполняет весь полнофункциональный цикл получения и обработки данных:

  • получение изображения чипа, используя CCD-камеру;
  • автоматическое наложение сетки на полученное изображение;
  • вычисление сигналов ячеек биочипа;
  • анализ сигналов ячеек биочипа;
  • отображение отчета.


ImaGelAssay

Программа на основе полученных изображений строит калибровочные кривые для определения 6 онко-маркеров, и рассчитывает концентрацию ПСА общего, ПСА свободного, АФП, ХГЧ, РЭА и НСЕ в анализируемом образце сыворотке крови.


ImaGel QualityControl

Программа предназначена для анализа воспроизводимости данных или для изучения поведения данных при изменении экспериментальных условий.

С ее помощью удобно сравнивать чипы, например, из разных партий или эксперименты с использованием разных красителей.


основные элементы технологии
принцип работы
сравнение гелевых и поверхностных биочипов
обработка данных