Вернуться на главную страницу > технология > сравнение гелевых и поверхностных биочипов
лаборатория технология публикации новости связь с нами карта сайта
Достоинства трехмерных биологических микрочипов
  • в гидрогеле иммобилизованные молекулы сохраняют биологическую активность
  • каждая ячейка микрочипа является индивидуальной нанопробиркой зонда
  • специфичность
  • число иммобилизуемых зондовых молекул на 2-3 порядка выше, чем в поверхностных микрочипах
  • высокая интенсивность сигнала.
Сравнение молекулярных взаимодействий на поверхностных (слева) и гелевых (справа) микрочипах.
Хранение

Сроки хранения гелевых олигонуклеотидных биочипов при комнатной температуре могут превышать один год, в то время как сроки хранения поверхностных чипов в тех же условиях обычно составляют около двух месяцев.

Сроки хранения белковых микрочипов при температуре от 4 до 8o составляет 12 месяцев.


 
Кинетика

Каждый из основных типов поверхностных и гелевых биочипов обладает своими достоинствами и относительными недостатками. В частности, кинетика гибридизации на поверхностных биочипах оказывается более быстрой, чем на гелевых чипах. Однако, на поверхностных чипах подложка вносит существенную неоднородность в молекулярные взаимодействия и приводит к «размазыванию» значений константы ассоциации при образовании комплексов между зондами и анализируемыми молекулами.

Чтобы избежать влияния поверхности, в большинстве матричных поверхностных олигонуклеотидных биочипов однонитевая зондовая ДНК является или продолжением дуплексного линкера длиной около 15-30 п.н., или продолжением одноцепочечного линкера типа поли-T. Как показывает анализ термодинамических взаимодействий, в отличие от поверхностных чипов, в гелевых биочипах взаимодействие между молекулами ДНК примерно такое же, как в растворе, и подобный линкер не требуется.

Более того, несмотря на несколько более медленную кинетику гибридизации в гелевых ячейках, как сигналы флуоресценции, так и дискриминация между совершенными и несовершенными комплексами оказываются выше в гелевых чипах уже на ранней стадии гибридизации.

Кинетику связывания на белковых микрочипах можно ускорить примерно в пять раз, используя перемешивание в растворе с помощью перестатического насоса, возбуждения поверхностных волн и др.

основные элементы технологии
принцип работы
сравнение гелевых и поверхностных биочипов
обработка данных