Лаборатория биологических микрочипов

> публикации

лаборатория технология публикации новости связь с нами

2008 |2007 | 2006 | 2005 | 2004 | 2003 | 2002 | 2001 | 2000 | главы из монографий | обзоры | ранние публикации

¤2009

Получение и характеристика моноклональных антител к холерному токсину.

Петрова Е.Э., Комалева Р Л., Е.Лахтина, Л.В. Самохвалова, Н.А.Калинина, Н.С.Сошина, А.Ю.Рубина, М.А.Филиппова, Ю.В.Вертиев, Т.И.Валякина, Е.В.Гришин.

(2009) Биоорганическая химия, N3, 357-367.

Биочиповые технологии в диагностике социально-значимых многофакторных заболеваний.

Гра О.А., Кожекбаева Ж.М., Гра Д.В., Федорова Ю.Ю., Скотникова О.И., Киселева Н.П., Киселев Ф.Л., Голденкова-Павлова И.В., Наседкина Т.В.

(2009) Вестник биотехнологии и физико-химической биологии, ? 1 (в печати).

Технология гидрогелевых биочипов и ее применение в медицинской лабораторной диагностике.

Д.А. Грядунов, Д.В. Зименков, В.М. Михайлович, Т.В. Наседкина, Е.И. Дементьева, А.Ю. Рубина, С.В. Паньков, В.Е. Барский, А.С. Заседателев.

(2009) Лаборатория. т.3 (11). стр. 10-14

Статья (в формате PDF, 849K)

Mолекулярно-генетические и бактериологические методы диагностики M. tuberculosis с множественной лекарственной устойчивостью.

Ф. Ф. Агаев, К. А. Алиев, Н. А. Салимова, Р. М. Абузаров, И. А. Гасымов, Д. А. Грядунов.

(2009) Проблемы туберкулеза и болезней легких. Т.86, N9, стр. 32-35

Separate production of single-stranded DNA is not necessary: Circuit denaturation of double-stranded DNA followed by hybridization of single strands on oligonucleotide microchips.

V.A. Vasiliskov, A.V. Chudinov, V.R. Chechetkin, S.A. Surzhikov, A.S. Zasedatelev, V.M. Mikhailovich

(2009) J. Biomol. Struct. Dyn., V.27, pp. 347-359

Hydrogel-based protein and oligonucleotide microchips on metal-coated surfaces: enhancement of fluorescence and optimization of immunoassay.

Zh.I. Zubtsova, D.A. Zubtsov, E.N. Savvateeva, A.A. Stomakhin, V.R. Chechetkin, A.S. Zasedatelev, A.Yu. Rubina

(2009), Journal of Biotechnology, 144, pp.151-159

Получение и характеристика моноклональных антител к дифтерийному токсину.

Т. И. Валякина, О. Е. Лахтина, Р. Л. Комалева, Симонова, Л. В. Самохвалова, Н. С. Шошина, Н. А. Калинина, А. Ю. Рубина, М. А. Филиппова, Ю. В. Вертиев, Е. В. Гришин.

(2009) Биоорганическая химия, Т.35, N5, c.618-628

Усиление сигнала флуоресценции на гелевых биочипах с зеркальной поверхностью и оптимизация процедуры иммуноанализа.

Ж.И. Зубцова, М.А. Филиппова, Е.Н. Савватеева, Д.А. Зубцов, В.Р. Чечеткин, Е.В. Гришин, А.С. Заседателев, А.Ю. Рубина

(2009) Доклады академии наук. Биофизика, биохимия, молекулярная биология. т. 427, N1, С. 118-121.

Kinetic effects on signal normalization in oligonucleotide microchips with labeled immobilized probes.

S.V. Pan'kov, V.R. Chechetkin, O.G. Somova, O.V. Antonova, O.V. Moiseeva, D.V. Prokopenko, R.A. Yurasov, D.A. Gryadunov, A.V. Chudinov

(2009) J. Biomol. Struct. Dyn., 2009, V. 27, N 2, pp. 235-244.

Олигонуклеотидный микрочип для одновременной идентификации шести возбудителей различной природы.

Мызникова А.И., Захарова Н.В., Грядунов Д.А., Чудинов А.В., Володин Н.Н., Заседателев А.С., Михайлович В.М.

(2009) Вопросы практической педиатрии. 2009; т.4 (1): с. 35-38.

Ассоциация полиморфных вариантов генов системы биотрансформации с атопическими заболеваниями у детей русской этнической принадлежности из республики Башкортостан.

Федорова Ю.Ю., Гра О.А., Карунас А.С., Хузина А.Х., Рамазанова Н.Н., Юлдашева А.А., Бикташева А.Р., Эткина Э.И., Наседкина Т.В., Голденкова-Павлова И.В., Хуснутдинова Э.К.

(2009) Молекулярная биология, Т.43, N6, стр. 1032-1039

Polymorphism of biotransformation genes and risk of relapse in childhood acute leukemia.

Gra O.A., Kozhekbaeva Zh.M., Makarova O.V., Samochatova H.V., Nasedkina T.V.

(2009) Balkan Journal of Medical Genetics, Vol. 12, N1, p. 21-35.

Diagnostic microarrays in hematologic oncology: applications of high- and low density arrays.

Nasedkina T.V., Guseva N.A., Gra O.A., Mityaeva O.N., Chudinov A.V., Zasedatelev A.S.

(2009) Molecular Diagnosis and Therapy, Vol. 13, N2, p. 91-102. Review.

Диагностика наследственно обусловленных заболеваний у детей с помощью ДНК-микрочиповой технологии.

Глотов А.С., Вашукова Е.С., Полушкина Л.Б., Потулова С.В., Глотов О.С., Иващенко Т.Э., Гра О.А., Наседкина Т.В., Аверьянова Н.С., Березнева Н.А., Пинелис В.Г., Баранов В.С.

(2009) Вопросы диагностики в педиатрии, Т. 1, ? 1, стр. 14-17.

Ассоциация полиморфизма NAT2 с риском развития псориаза в московской популяции.

Ж.М. Кожекбаева, О.А. Гра, В.С.Фадеев, И.В. Голденкова-Павлова, И.М. Корсунская, С.А. Брускин, Е.Е. Агафонова, Ан.Л.Пирузян, С.А.Суржиков, Т.В. Наседкина.

(2009) Молекулярная биология, , т.43, N1, с.1-15.

Quantification of Target Proteins using Hydrogel Antibody Arrays and MALDI time-of-flight Mass Spectrometry (A2M2S)

Ekaterina Darii, Diane Lebeau, Nelly Papin1, Alla Y. Rubina, Andrei Stomakhin,Jorg Tost, Sascha Sauer, Elena Savvateeva, Ekaterina Dementieva, Alexander Zasedatelev, Alexander A. Makarov, and Ivo G. Gut

(2009), New Biotechnology, Volume 25, Issue 6, 15 September 2009, Pages 404-416

Биологический микрочип для одновременного количественного иммуноанализа маркеров онкологических заболеваний в сыворотке крови человека.

Савватеева Е.Н., Дементьева Е.И., Цыбульская М.В., Осипова Т.В., Рябых Т.П., Турыгин А.Ю., Юрасов Р.А., Заседателев А.С., Рубина А.Ю.

(2009), Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, N6, с.679-683.

Получение и характеристика моноклональных антител к холерному токсину.

Е.Лахтина, Л.В. Самохвалова, Н.А.Калинина, Н.С.Сошина, А.Ю.Рубина, М.А.Филиппова, Ю.В.Вертиев, Т.И.Валякина, Е.В.Гришин.

(2009), Биоорганическая химия, Т.35, N3, с.357-367

TPMT genetic variations in populations of the Russian Federation.

Samochatova EV, Chupova NV, Rudneva A, Makarova O, Nasedkina TV, Fedorova OE, Glotov AS, Kozhekbaeva Zh, Maiorova OA, Roumyantsev AG, Krynetski EY, Krynetskaia NF, Evans WE, Ribeiro RC.

(2009) Pediatr Blood Cancer. Feb;52(2):203-8.

New indocyanine derivatives for the synthesis of fluorescently labeled oligonucleotides.

Timofeev E.N., Kuznetsova V.E., Zasedatelev A.S., Chudinov A.V.

(2009) Lett. Organ. Chemistry 6, N1, p.71-76,

¤2008

Уровень транскрипции гена MYCN в клетках крови больных гемобластозами.

Малахо С.Г., Никитин Е.А., Наседкина Т.В., Полтараус А.Б.

(2008) Молек. Биол., т. 42, 378-382

The 4154delA mutation carries in the BRCA1 gene share a common ancestry.

Ozolina S., Sinicka O., Jankevics E., Inashkina I., Lubinski J., Gorski B., Gronwald J., Nasedkina T., Fedorova O., Lyubchenko L., Tihomirova L.

(2008) Fam. Cancer (9dec 2008, Epub ahead of print)

Определение фенотипических характеристик индивида по анализу генетических маркеров с помощью биологических микрочипов.

Наседкина T., Фесенко Д. О., Митяева О., Лысов Ю.П., Макаров А.А., Заседателев А.С.

(2008) Докл. Акад. Наук, т. 422, 35, 1-4.

Новые индодикарбоцианиновые красители для технологии биологических микрочипов.

В. Е. Кузнецова, В. А. Василисков, О. В. Антонова, В. М. Михайлович, А. С. Заседателев, А. В. Чудинов

(2008) Биоорганическая химия, 34 (1): 141-144

Metabolizing gene polymorphism analysis and susceptibility to lymphoproliferative diseases in Russian population.

Nasedkina T.V., Gra O.A., Kozhekbaeva Zh.M., Zasedatelev A.S.

(2008), Chapter IX in book: Population Genetics Research Progress. Editor: V. T. Koven. Nova Science Publishers, Inc. p.245-277.

Типирование локуса АВ0 с помощью биологического микрочипа - новый уровень решения задач судебно-медицинской биологической экспертизы вещественных доказательств.

Иванов П.Л., Каганова Н Л, Земскова Е.Ю., Бинько И.А., Митяева О.Н., Фесенко Д. О., Наседкина T.В.

(2008) Судебно-медицинская экспертиза, 51(2):11-17.

Молекулярно-биологический микрочип ТБ-БИОЧИП-2 для определения чувствительности Mycobacterium tuberculosis с множественной лекарственной усточивостью к фторхинолонам у больных с впервые выявленным и хроническим течением туберкулеза

Носова Е. Ю., Галкина К. Ю., Антонова О. В., Гармаш Ю. Ю., Скотникова О. И., Мороз А.М.

(2008) Вестник Российской Академии медицинских наук. Т.3, 16-19

Первый прорыв нового для России генотипа 2.3.2 высоковирулентного вируса гриппа A/H5N1 на Дальнем Востоке

Львов Д. К., Щелканов М. Ю., Власов Н. А., Прилипов А. Г., Дерябин П. Г., Федякина И. Т., Галкина И. В., Забережный А. Д., Ляпина О. В., Шляпникова О. В., Киреев Д. Е., Фесенко Е. Е., Калмыков М. В., Виткова О. Н., Морозова Т. Н., Прошина Е. С., Гребенникова Т. В., Аканина Д. С., Самохвалов Е. И., Альховский С. В., Волков В. А., Семенов В. И., Гапонов В. В., Шмаков Н. И., Кушнир А. Т., Казарян А. С., Стариков Н. С., Петренко М. С., Славский А. А., Литвин К. Е., Щербакова Л. О., Фролов А. В., Манин Т. Б., Уманец О. А., Бандеев В. В., Хван А. М., Дунаев В. Г., Челедина Т. П., Абгарян С. Р., Михайлович В. М., Заседателев А. С., Любченко Е. Н., Флягин В. Н., Тихонова И. Ф., Маслов Д. В., Ананьев В. Ю., Баранов Н. И., Гореликов В. Н., Яковлев С. С., Алипер Т. И., Непоклонов Е. А., Suarez D.

(2008) Вопросы вирусологии, т.5, 4-9

Novel water-soluble asymmetric indodicarbocyanine dyes: synthesis, properties and bioconjugation.

Kuznetsova V.E., Vasiliskov V.A., Zasedatelev A.S., Chudinov A.V.

(2008) Mendeleev Communications, N3, 138-140.

Polymorphisms in xenobiotic-metabolizing genes and the risk of Chronic Lymphocytic Leukemia and Non-Hodgkin's Lymphoma in adult Russian patients.

Gra O.A., Glotov A.S., Nikitin E.A., Glotov O.S., Kuznetsova V.E., Chudinov A.V., Sudarikov A.B., Nasedkina T.V.

(2008), American Journal of Hematology, Vol. 83, N4, p.279-287

Генетический полиморфизм GST, NAT2, и MTRR и предрасположенность к развитию острого лейкоза у детей.

Гра О.А., Глотов А.С., Кожекбаева Ж.М., Макарова O.В., Наседкина Т.В., Заседателев A.C.

(2008) Молек. биология, Т. 42, N2, 1-13.

Simultaneous qualitative and quantitative identification of multiple targets by polymerase chain reaction on microarray.

Zakharova N., Drobyshev A., Khodakov D., Myznikova A., Gorban I. Simultaneous qualitative and quantitative identification of multiple targets by polymerase chain reaction on microarray.

(2008) In: Oligonucleotide Array Sequence Analysis. Nova Science Publishers, Inc. Editors M.K.Moretti & L.J.Rizzo. Chapter 132, pp. 385-404

Gel-based oligonucleotide microarray approach to analyze protein-ssDNA binding specificity

Olga A. Zasedateleva,* Andrey L. Mikheikin, Alexander Y. Turygin, Dmitry V. Prokopenko, Alexander V. Chudinov, Elena E. Belobritskaya, Vladimir R. Chechetkin, and Alexander S. Zasedatelev

(2008), Nucleic Acids Res. 2008 June; 36(10): e61

DNA microarrays in the clinic: infectious diseases.

Mikhailovich V.M., Gryadunov D.A., Kolchinsky A.M., Makarov A.A.

(2008) Bioessays, v. 30, 673-682.

Why 3-D Gel-based microarrays in proteomics.

Rubina A.Yu., Kolchinsky A.A., Makarov A.A., Zasedatelev A.S.

(2008), Proteomics, v. 8, 817-831

An oligonucleotide microarray for multiplex real-time PCR identification of HIV-1, HBV, and HCV.

Khodakov D.A., Zakharova N.V., Gryadunov D.A., Filatov F.P., Zasedatelev A.S., Mikhailovich V.M.

(2008), BioTechniques, v 44(2) p.28-34.

Выявление мутаций в геноме Mycobacterium tuberculosis, приводящих к устойчивости к фторхинолонам, методом гибридизации на биологических микрочипах.

Антонова О.В., Грядунов Д.А., Лапа С.А., Кузьмин А.В., Ларионова Е.Е.,.Смирнова Т.Г, Носова Е.Ю., Скотникова О.И., Черноусова Л.Н., Мороз А.М., Заседателев А.С., Михайлович В.М.

(2008), Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. Т. 145(1), с. 115-120.

Изучение лекарственной чувствительности Mycobacterium tuberculosis к фторхинолонам путем выявления мутаций в гене gyrA.

Носова Е.Ю., Галкина К.Ю., Маркова О.В., Грядунов Д.А., Скотникова О.И.

(2008) Проблемы туберкулеза и болезней легких, 10, 57-61

An RNA microchip containing immobilized oligoribonucleotides with protective groups at 2`-O- positions

Andrey L. Mikheikin, Sergey A. Surzhikov, Olga A. Zasedateleva, Vadim A. Vasiliskov, Sergey V. Pan'kov, Irina V. Grechishnikova, Lev L. Kisselev, and Alexander S. Zasedatelev

(2008), BioTechniques 44:77-83, doi 10.2144/000112677

¤2007

Biochip-based test-system for prostate cancer diagnostics

T.Osipova, T.Ryabykh, A.Rubina, E.Dementieva, E.Savvateeva, E.Konovalova, Z.Sokolova, V.Matveev, A.Baryshnikov, A.Zasedatelev

(2007), В сборнике статей по материалам конференции "New aspects of biotechnology and medicine", Chapter 3, pp.15-28, Editors: A.Egorov, E.Zaikov, Nova Science Publishers,Inc.

Генетический полиморфизм GST, NAT2 и MTRR и предрасположенность к развитию острого лейкоза у детей.

Гра О.А., Глотов А.С., Кожекбаева Ж.М., Макарова О.В., Наседкина Т.В.

(2007) Молекулярная биология, Т. 42, ? 2, стр. 1-13.

Ассоциация полиморфизма генов системы биотрансформации CYP1A1 и GST's с риском развития рецидива острого лейкоза у детей.

Гра О.А.

(2007) Педиатрическая фармакология, Т. 4, ? 3, стр. 45-49.

Микрочипы в диагностике лимфопролиферативных заболеваний.

Наседкина Т.В., Гусева Н.А., Митяева О.Н., Гра О.А., Федорова О.Е., Кожекбаева Ж.М., Глотов А.С., Паньков С.В., Юрасов Р.А., Чудинов А.В., Заседателев А.С.

(2007) Молекулярная медицина, ? 3, стр. 54-60.

Comparison of surface and hydrogel-based protein microchips

D.A. Zubtsov, E.N. Savvateeva, A.Yu. Rubina, S.V. Pan'kov, E.V. Konovalova, O.V. Moiseeva, V.R. Chechetkin, A.S. Zasedatelev

(2007), Analytical Biochemistry, V. 368, N 2, pp. 205-213.

Effects of external transport on discrimination between perfect and mismatch duplexes on gel-based oligonucleotide microchips

N. V. Sorokin, D. Y. Yurasov, A. I. Cherepanov, J. M. Kozhekbaeva, V. R. Chechetkin, O. A. Gra, M. A. Livshits, T. V. Nasedkina, A. S. Zasedatelev.

(2007), J. Biomol. Struct. Dyn., V.24, N6, pp.571-578

Quantification of Target Proteins using Hydrogel Antibody Arrays and MALDI time-of-flight Mass Spectrometry (A2M2S).

E. Darii, D. Lebeau, N. Papin, A.Y. Rubina, A. Stomakhin, J. Tost, S. Sauer, E.Savvateeva, E. Dementieva, A. Zasedatelev, A. A. Makarov, I.G. Gut.

(2007), Proteomics (in press.)

Analysis of T-cell receptor-γ gene rearrangements using oligonucleotide microchip.

O.A. Gra, J.V. Sidorova, E.A. Nikitin, A.Y. Turygin, S.A. Surzhikov, A.L. Melikyan, A.B. Sudarikov, A.S. Zasedatelev, T.V. Nasedkina.

(2007), Journal of Molecular Diagnostics Vol. 9, ? 2, pp. 249-257

2-Aminopyridine - label for bridging of oligosaccharides HPLC profiling and glycoarray printing

Shilova N.V., Galanina O.E., Rubina A.Yu., Dyukova V.I., Huflejt M, Chambers J., Roucoux A., Bovin N.V.

(2007) Glucoconjugate Journal (in press)

Разработка биочипа для количественного определения двух форм простата-специфического антигена с использованием внутренней калибровочной кривой.

Е.В. Коновалова, Е.Н. Савватеева, Е.И. Дементьева, М.А. Филиппова, А.Ю. Турыгин, Т.В. Осипова, Т.П. Рябых, А.Ю. Рубина, А.С. Заседателев.

(2007), Молекулярная биология Т. 41, ? 4, с.734-738.

Зависимость между возникновением стабильной артериальной гипертензии у детей и полиморфизма генов ренин-ангиотензиновой и кинин-брадикининовой системы.

А.Глотов, Т.Иващенко, Г.Образцова, Т.Наседкина, В.Баранов.

(2007) Молекулярная биология, т. 41, 18-25

Биологический микрочип для идентификации ортопоксвирусов и возбудителей, вызывающих схожую с натуральной оспой клиническую картину.

Мызникова А. И., Лапа С.А., Грядунов Д.А., Ходаков Д.А., Заседателев А.С., Михайлович В.М.

(2007) Вопросы вирусологии. Том 2. (в печати)

Разработка и применение гидрогелевых олигонуклеотидных микрочипов для судебно-медицинской идентификации личности на примере локуса AB0.

Митяева О.Н., Фесенко Д.О., Наседкина Т.В., Лысов Ю.П., Барский В.Е., Заседателев А.С., Иванов П.Л.

(2007) Судебно медицинская экспертиза. (в печати).

Определение функционально-значимых мутаций гена NAT2 с помощью биологических микрочипов.

Ж.М. Кожекбаева, А.С. Глотов, О.А. Гра, И.В. Голденкова-Павлова, С.А. Брускин, Е.Е. Агафонова, Е.В. Маркарова, Р.М. Абдеев, И.М. Корсунская, Ан. Л. Пирузян, В.Е. Барский, А.С. Заседателев, Т.В. Наседкина.

(2007) Молекулярная биология, Т. 41, ? 4, стр. 725-733.

Использование биочипов при изучении распространенных мутаций в генах BRCA1/2 и CHEK2 у больных органоспецифическим раком яичников и первично-множественными злокачественными новообразованиями с поражением яичников (российская популяция).

О.Е. Федорова, Л.Н Любченко, Ю.Г. Паяниди, Т.П. Казубская , Ф.А. Амосенко, Р.Ф. Гарькавцева, А.С. Заседателев, Т.В. Наседкина.

(2007) Молекулярная биология, т. 41, ? 1, стр.37-42.

¤2006

Биочипы для медицинской диагностики

В.Р.Чечеткин, Д.В.Прокопенко, А.А.Макаров, А.С.Заседателев

(2006) Российские нанотехнологии, том 1, ? 1,2

Тест-система в формате биочипа для диагностики рака предстательной железы

Рябых Т.П., Осипова Т.В., Дементьева Е.И., Савватеева Е.Н., Коновалова Е.В., Соколова З.А., Рубина А.Ю., Барышников А.Ю., Заседателев А.С.

(2006) Российский биотерапевтический журнал, в печати.

Разработка диагностической тест-системы на основе биочипа на простатический специфический антиген (общую и свободную формы)

Рябых Т.П., Осипова Т.В., Дементьева Е.И., Савватеева Е.Н., Коновалова Е.В.,. Соколова З.А, Рубина А.Ю., Барышников А.Ю., Заседателев А.С.

(2006)Российский биотерапевтический журнал, ? 1, Т. 5, С. 10

Тест-система в формате биочипа для одновременного количественного определения общей и свободной форм простата-специфического антигена в сыворотке крови.

(2006) Российский биотерапевтический журнал, Т. 5, С. 49-57.

Design of carbohydrate multiarrays

V.I. Dyukova, N.V. Shilova, O.E. Galanina, A.Yu. Rubina, N.V. Bovin

(2006) Biochimica et Biophysica Acta 1760(4) 603-609.

Опыт использования биочипов для анализа полиморфных вариантов гена CYP1A1 при лейкозах у детей.

Гра О.А., Глотов А.С., Кожекбаева Ж.М., Макарова О.В., Самочатова Е.В., Заседателев А.С., Наседкина Т.В.

(2006) Медицинская генетика, ? 4, стр. 34-38.

Rapid genotyping of common deficient thiopurine S-methyltransferase (TPMT) alleles using the DNA-microchip technique

Tatyana V.Nasedkina, Olga F.Fedorova, Andrei S.Glotov, Natalia V.Chupova, Elena V.Samochatova, Olga A.Maiorova, Valeria V.Zemlyakova, Anastasia E.Roudneva, Alexander V.Chudinov, Roman A.Yurasov, Janna M.Kozhekbaeva, Victor E.Barsky, Eugene Y.Krusnetskiy, Natalia F. Krusnetskaia, Cheng Cheng, Raul C.Ribeiro, William E.Evans, Alexander G.Roumyantsev, Alexandr S.Zasedatelev.

(2006) Eur. J. Human Genetics, 14, 991-998

Сравнительный анализ результатов фенотипирования и генотипирования по полиморфизму N-ацетилирования у человека.

И.В. Голденкова-Павлова, С.А. Брускин, Р.М. Абдеев, Е.В. Маркарова, С. Г. Бигвава, Л.А. Радкевич, Х.А. Курданов, Ж.М. Кожекбаева, А.С. Глотов, О.А. Гра, А.С. Заседателев, Т.В. Наседкина, Э.С. Пирузян.

(2006) Генетика. Т. 42. ? 8. с. 1443-1450.

Анализ точечных мутаций в гене BRCA1 методом гибридизации с гидрогелевыми микрочипами.

О. Е. Федорова, О. Н. Синицка , Л. П. Тихомирова , Я. В. Вишневская, А. С. Заседателев, Т. В. Наседкина.

(2006) Мол. Биол., т.40, ?1, с.1-6

Effect of mixing on reaction-diffusion kinetics for protein hydrogel-based microchips

D.A. Zubtsov, S.M. Ivanov, A.Yu. Rubina, E.I. Dementieva, V.R. Chechetkin, A.S. Zasedatelev

(2006)Journal of Biotechnology V. 122, N 1 16-27

Kinetics of Hybridization on Surface Oligonucleotide Microchips: Theory, Experiment, and Comparison with Hybridization on Gel-Based Microchips

N. V. Sorokin, V. R. Chechetkin, S. V. Pan'kov, O. G. Somova, M. A. Livshits, M. Y. Donnikov, A. Y. Turygin, V. E. Barsky, A. S. Zasedatelev

(2006)Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, V. 24, N 1, pp. 57-66 .

Использование биологических микрочипов в онкогематологии.

Т.В.Наседкина.

(2006) Онкогематология , ? 1-2, стр.25-37

Олигонуклеотидные биочипы в диагностике неонатальных вирусных инфекций.

А.И.Мызникова, Л.З.Файзуллин, Н.В.Захарова, Д.А.Грядунов, Н.Н.Володин, В.Е.Барский, В.М.Михайлович.

(2006) Вопросы. Практической педиатрии Т.1, 61-64

¤2005

Генетический полиморфизм тиопурин-S-метилтрансферазы в лечении детей с острым лимфобластным лейкозом.

Н.В.Чупова, Е.В.Самочатова, А.Е.Руднева, Г.Г.Солопова, Т.В.Наседкина, О.Е.Федорова, А.С.Глотов, В.В.Землякова, Е.Ю.Крынецкий, Н.Ф.Крынецкая, Р.К.Рибейро, В.Э.Эванс, А.Г.Румянцев.

(2005) Гематология и трансфузиология, т.50, ?6, с. 3-9

Evaluation of hybridisation on oligonucleotide microarrays for analysis of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis.

D. Gryadunov, V. Mikhailovich, S. Lapa, N. Roudinskii, M. Donnikov, S. Pan'kov, O. Markova, A. Kuz'min, L. Chernousova, O. Skotnikova, A. Moroz, A. Zasedatelev, A.Mirzabekov.

(2005) Clinical Microbiology and Iinfection, v. 11, p.531-539.

Биологические микрочипы для медицинской диагностики.

Заседателев А.С.

(2005) Наука и Технология в Промышленности т. 1, 18-20

Discrimination between Perfect and Mismatched Duplexes with OligonucleotideGel Microchips: Role of Thermodynamic and Kinetic Effects during Hybridization

N.V. Sorokin, V.R. Chechetkin, M.A. Livshits, S.V. Pan'kov, M.Y. Donnikov, D.A. Gryadunov, S.A. Lapa , A.S. Zasedatelev

(2005) J. Biomol. Structure & Dynamics, v. 22, 725-734.

Создание биочипа для анализа полиморфизма в генах системы биотрансформации

Глотов А.С., Наседкина Т.В., Иващенко Т.Э., Юрасов Р.А., Суржиков С.А., Паньков С.В., Чудинов А.В., Баранов В.С., Заседателев А.С.

(2005) Мол. Биол., 39(3), p.403-412.

Biosensing and monitoring of cell populations using the hydrogel bacterial microchip.

D.O. Fesenko, T.V. Nasedkina, D.V. Prokopenko, A.D. Mirzabekov.

(2005) Biosensors and Bioelectronics. v.20, 1860-1865.

Hydrogel glycan microarrays.

V.I. Dyukova, E.I. Dementieva, D.A. Zubtsov, O.E. Galanina, N.V. Bovin, A.Yu. Rubina.

(2005) Anal. Biochem, 347, p. 94-105

Quantitative immunoassay of biotoxins on hydrogel-based protein microchips

Rubina A., Duykova V., Dementieva E., Stomakhin A., Nesmeyanov E., Grishin E., Zasedatelev A.

(2005) Anal. Biochem., v. 340, 317-329

Glycan microarrays on the basis of three-dimensional hydrogels

Dyukova V., Rubina A., Dementieva E., Galanina O., Bovin N, Zasedatelev A

(2005) Glucoconjugate Journal, v. 22 p. 191.

Определение точечного нуклеотидного полиморфизма в гене р53 с помощью селективного лигирования и амплификации по принципу катящегося кольца на микрочипах

Кашкин К., Стрижков Б., Грядунов Д., Суржиков С., Гречишникова И., Крейндлин Э., Чупеева В., Евсеев К., Турыгин А., Мирзабеков А.

(2005) Мол. Биол., T. 39, 26-35.

Альгинатный гелевый микрочип для наблюдения в реальном времени внутриклеточных процессов в бактериальных и дрожжевых клетках.

Фесенко Д.О., Наседкина Т.В., Чудинов А.В, Прокопенко Д.В., Юрасов Р.А., Заседателев А.С.

(2005) Мол. Биол. Т. 39, ? 1, c. 97-103.

¤2004

Новые технологии определения лекарственной чувствительности Mycobacterium tuberculosis.

Скотникова О. И., Михайлович В.М., Носова Е. Ю, Лапа С. А., Грядунов Д. А., Донников М. Ю., Бадлеева М. В, Галкина К. Ю, Дорожкова И. Р, Литвинов В. И, Заседателев А. С., Мороз А. М., Мирзабеков А.Д.

(2004),Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2004;(6):40-2.

Хромосомные аберрации при остром лимфобластном лейкозе у детей

Е.А. Исаева, В.С. Жаринов, Т.В. Наседкина, О.Н.Митяева, Е.Р. Рогачева, Д.Б.Лаврухин, А.И. Карачунский, А.С.Заседателев, А.Г. Румянцев

(2004) Детская онкология, ?3-4

Анализ хромосомных транслокаций с участием гена MLL методом гибридизации с олигонуклеотидными микрочипами

О.Н.Митяева, Т.В.Наседкина, В.С.Жаринов, Е.А.Исаева, А.Ю.Турыгин, В.В.Чупеева, Э.Я.Крейндлин, А.Д.Мирзабеков

(2004), Virology, 38(3), 449-456.

Biochip: Diagnoses

Lapa S., Gryadunov D.

(2004) Science in Russia (published by the Russ. Acad. Sci. Presidium) 6, 33-37.

Diversity of HIV-1 Subtype A and CRF03_AB Protease in Eastern Europe: Selection of the V77I Variant Followed by Its Rapid Spread in IDU Populations.

Roudinskii, A. Sukhanova, E. Kazennova, J. Weber, V. Pokrovsky, V. Mikhailovich, A. Bobkov.

(2004) J. Virology, 78, ?20, 11276-11287.

Генетическая изменчивость области, кодирующей протеазу, у изолятов ВИЧ-1 подтипа А и рекомбинантов Сrf03_АВ на территории СНГ

А.Л.Суханова, Е.В.Казеинова, Н.И Рудинский, В.М. Михайлович, Д.А. Грядунов, А.В.Будилов, М. А Булавкина, J.N.Weber В.В.Покровский, А.Ф.Бобков

(2004) J. Virology, 78, ?20, 11276-11287.

Генетическая изменчивость области, кодирующей протеазу, у изолятов ВИЧ-1 подтипа а и рекомбинантов Сrf03_AB на территории СНГ

А.Ф.Бобков, А.Л.Суханова, В.В.Покровский, Е.В.Казеннова, J.N.Weber Рудинский Н.И., В.М. Михайлович, Грядунов Д.А., Булавкина М.А.

(2004) Вопросы вирусологии, 6, 4-9.

Разработка биологических микрочипов для выявления мутаций устойчивости ВИЧ-1 к ингибиторам протеазы и результаты их применения.

Рудинский Н.И., Михайлович В.М., Донников М.Ю., Лапа С.А. А.Ф.Бобков, А.Л.Суханова, В.В.Покровский, Е.В.Казеннова

(2004) Вопросы вирусологии, #6, 10-15.

Микрочипы на основе трехмерных ячеек геля: история и перспективы.

Колчинский А. М., Грядунов Д. А., Лысов Ю. П., Михайлович В. М.,. Наседкина Т. В, Турыгин А. Ю.,. Рубина А. Ю, Барский В. Е., Заседателев А. С.

(2004) Мол. Биол., Т. 38, 5-16.

Применение белковых микрочипов для количественного определения опухолеассоциированных маркеров.

Дементьева Е.И., Рубина А.Ю, Дарий Е.Л., Дюкова В.И., Заседателев А.С., Осипова Т.В, Рябых Т.П.,.Барышников А.Ю, Мирзабеков А.Д.

(2004) Докл. Акад. Наук. Т. 395, 1-6.

Hydrogel drop microchips with immobilized DNA: properties and methods for large-scale production

Rubina A.Yu., Pan'kov S.V., Dementieva E.I., Pen'kov D.N., Butygin A.V., Vasiliskov V.A., Chudinov A.V.,. Mikheikin A.L., Mikhailovich V.M, Mirzabekov A.D.

(2004) Anal. Biochem. V. 325, 92-106.

Use of 16S rRNA, an 23S rRNA, and gyrB gene sequence analysis to determine phylogenic relationships of Bacillus cereus group microorganisms.

S.Bavykin, Yu.Lysov, V.Zakhariev, J.Kelly, J.Jackman, D.Stahl, A.Cherni.

(2004) J. Clin. Microbiology, v. 42, 3711-3730

¤2003

Radioisotopic, culture-based, and oligonucleotide microchip analyses of thermophilic microbial communities in continental high-temperature petroleum reservoirs.

Bonch-Osmolovskay E.,Miroshnichenko M., Lysov Yu., Perov A., Mirzabekov A., Hippe H., Jeanthon C.

(2003) Appl. Environ. Microbiol., v. 69, 6143-6151

Видовая идентификация ортопоксвирусов на олигонуклеотидных микрочипах.

Михеев М. В., Лапа С. А., Щелкунов С. Н., Чикова А. К., Михайлович В. М., Соболев А. Ю., Грядунов Д. А., Бабкин И. В., Булавкина М. А., Гуськов А. А., Сокунова Е. Б., Кочнева Г. В., Блинов В. М., Сандахчиев Л. С., Заседателем А. С., Мирзабеков А.

(2003),Вопросы вирусологии, 48(1):4-9

Идентификация штаммов Mycobacterium tuberculosis с одновременным определением их лекарственной устойчивости методом гибридизации на олигонуклеотидных микрочипах.

Д.А. Грядунов, В. М. Михайлович, С. А. Лапа, Н. И. Рудинский, В. Е. Барский, А. В. Чудинов, А. С. Заседателев, А. Д. Мирзабеков.

(2003), Молекулярная генетика, микробиология, вирусология, (4):24-7

Типирование штаммов M. tuberculosis, устойчивых к рифампицину и изониазиду с использованием молекулярно-билогических методов.

Скотникова О, Носова Е, Маркова О, Иртуганова О, Круду В, Гинда С, Голышева О, Бирюкова М, Стрельцова Е, Кальянина О, Литвинов В, Мороз А, Грядунов Д., Лапа С., Михайлович В.

(2003), Бюллетень Экспериментальной Биологии и Медицины, 136(3):273-275

Protein microchips. Analysis of the expression of recombinant barstar, Dokl Biochem Biophys.

E.I. Dementieva, A.Yu. Rubina, A.A. Stomakhin, S.M. Ivanov, A.Ya. Kreindlin, D.S. Ivanov, D.V. Rodin, S.M. Deyev, V.S. Prasolov, and A.D. Mirzabekov.

(2003), V. 393, P. 116-120.

Analysis of Binding Specificity of Disulfide Bonded Dimeric λ-Cro V55C Protein with Generic Hexamer Oligonucleotide Microchip

V.R. Chechetkin, D.V. Prokopenko, O.A. Zasedateleva, G.I. Gitelson, E.S. Lomakin, M.A. Livshits, L. Malinina, A.Y. Turygin, A.S. Krylov and A.D. Mirzabekov

(2003), Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, ISSN 0739-1102, Volume 21, Issue Number 3, ©Adenine Press (2003)

¤2002

Fluorescence Data Analysis on Gel-Based Biochips

V.Barsky, A.Perov, S.Tokalov, A.Chudinov, E. Kreindlin, A. Sharonov, E. Kotova, A. Mirzabekov

(2002) Journal of Biomolecular Screening, 7, 247-257

Radical-generating coordination complexes as tools for rapid and effective fragmentation and fluorescent labeling of nucleic acids for microchip hybridization.

Kelly J.J., Chernov B. K., Tovstanovsky I., Mirzabekov A. D., and Bavykin S. G.

(2002) Anal. Biochem. 311, 103-118.

Species-level identification of orthopoxviruses with an oligonucleotide microchip.

Lapa S., Mikheev M., Shchelkunov S., Mikhailovich V., Sobolev A., Blinov V., Babkin I., Guskov A., Sokunova E., Zasedatelev A., Sandakhchiev L., and Mirzabekov A.

(2002) J. Clin. Microbiol. 40, 753-757.

Identification of chromosomal translocations in Leukemias by hybridization with oligonucleotide microarrays

T. Nasedkina, P. Domer, V. Zharinov, J. Hoberg, Yu. Lysov, A. Mirzabekov

(2002) Haematologica; 87: 363-372 http://www.haematologica.ws/2002_04/363.htm

Specificity of mammalian Y-box binding protein p50 in interaction with ss and ds DNA analyzed with generic oligonucleotide microchip

Zasedateleva O., Krylov A., Prokopenko D., Skabkin M., Ovchinnikov L., Kolchinsky A., Mirzabekov A.

(2002) J. Mol. Biol. 324, 73-87

Применение матричных биочипов с иммобилизованной ДНК в биологии и медицине

Мирзабеков А., Прокопенко Д., Чечеткин В.

(2002) В сб.: Информационные медико-биологические технологии, под общ. ред. В.А. Княжева, К.В. Судакова, стр. 166-197. Изд. Дом ГЭОТАР-МЕД, Москва.

Биологические микрочипы, содержащие иммобилизованные в гидрогеле нуклеиновые кислоты, белки и другие соединения: Свойства и приложения в геномике.

Барский В.Е., Колчинский А.М., Лысов Ю.П., Мирзабеков А.Д.

(2002) Мол.биол., Т.36, ? 1, c.563-584.

Молекулярно-генетические методы выявления рифампицинрезистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis

Скотникова О., Соболев А., Михайлович В., Грядунов Д., Иртуганова О., Носова Е., Исаева Е., Лапа С., Заседателев А., Литвинов В., Мороз А., Мирзабеков А.

(2002) Вестн. Рос. Акад. Мед. Наук (2), стр. 36-39.

Флуоресценция мезо-тетракис4-(карбокси) фенилпорфина, ковалентно связанного с олигонуклеотидами в(СG)₅ и d(TA)₅.

Бессчетнова И., Чудинов А., Калюжный Д., Щелкина А., Борисова О., Токалов С., Кузнецова В., Лобанов А., Румянцева В., Барский В., Мирзабеков А.

(2002) Биофизика 47, 259-267.

Методы для идентификации мутаций

О.И. Скотникова, А.С. Заседателев, В.М. Михайлович, А. Ю.Соболев, Д. А. Грядунов, Е. Л. Исаева, С.А. Лапа.

(2002) Глава в монографии 'Лабораторная диагностика туберкулеза', Под редакцией В.И.Литвинова, А.М.Мороза. МНПЦБТ, 2002, стр. 91-115.

Клиническое значение микрочиповой технологии определения лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза.

И.Васильева, Л.Черноусова, А.Заседателев, А.Соболев, В., Михайлович.

(2002) Проблемы Туберкулеза, т.6, 21-24

Emerging array-based technologies in proteomics.

Mirzabekov, A. and Kolchinsky, A.

(2002) Current Opinion in Chem. Biol. 6, 70-75.

Analysis of SNPs and other genomic variations using gel-based chips.

Mirzabekov, A. and Kolchinsky, A.

(2002) Human Mutation 19 , 343-360

MAGIChip: Properties and applications in genomic studies.

Mirzabekov, A. and Kolchinsky, A.

(2002) In: Genomic Technologies: Present and Future, Functional Genomics Series, vol. 1, Chapter 6. Eds. D. J. Galas , S. J. McCormack. Caister Academic Press, 163-196

Properties, Manufacturing, and Applications of Micro Arrays of Gel Immobilized Compounds and Cells on a chip (MAGIChip).

Mirzabekov, A.

(2002) In ACS Symposium Series 815, Microfabricated Sensors, Application of Optical Technology for DNA Analysis, Kordal R., et al. (eds), ACS Books, Clarendon Hills, IL (2002), pp. 23-41

¤2001

A bacterial microchip: the principle of operation as exemplified by detection of antibiotics.

Fesenko D.O., Nasedkina T.V., Mirzabekov A.D.

(2001 Nov-Dec), Dokl Biochem Biophys. ;381:427-9. No abstract available.PMID: 11813561

Protein Microchips

A.Yu. Rubina, S.V. Pan'kov, S.M. Ivanov, E.I. Dement'eva, and Academician A.D. Mirzabekov.

(2001) Doklady Biochemistry and Biophysics, Vol. 381, 2001, pp. 419-422.

Detection of Bacillus anthracis Using Multiplex PCR on the Oligonucleotide Biochip.

D. A. Gryadunov, V. M. Mikhailovich, A. N. Noskov, S. A. Lapa, A. Yu. Sobolev, S. V. Pan'kov, A. Yu. Rubina, A. S. Zasedatelev, and Academician A. D. Mirzabekov.

(2001) Doklady Biochemistry and Biophysics, Vol. 381, 2001, pp. 384-386.

Parallel multiplex thermodynamic analysis of coaxial base stacking in DNA duplexes by oligodeoxyribonucleotide microchips

Vasiliskov, V., Prokopenko, D., Mirzabekov, A.

(2001) Nucl. Acids Res. 29, 2303-2313

Large-scale parallel analysis of the binding specificity of HU protein with ss and ds DNA on generic oligonucleotide microchips.

Krylov, A.; Zasedateleva, O.; Prokopenko D.; Rouviere-Yaniv, J.; Mirzabekov A.

(2001) Nucl. Acids Res. 29, 2654-2660.

Comparison of complex DNA mixtures with generic oligonucleotide microchips

Lebed J., Chechetkin V., Turygin A., & Mirzabekov A.

(2001) J. Biomol. Structure & Dynamics 18, N6, 813-823.

Optimization of an oligonucleotide microchip for microbial identification studies: a non-equilibrium dissociation approach.

Liu W. T., Mirzabekov A. D., and Stahl D. A.

(2001) Environ. Microbiol. 3, 619-629.

Advances in the analysis of DNA sequence variations using oligonucleotide microchip technology

Tillib S. and Mirzabekov A.

(2001) Current Opinion in Biotechnology, 12(1), 53-58

Integration of multiple PCR amplification and DNA mutation analyses by using oligonucleotide microchip

Tillib S., Strizhkov B., and Mirzabekov A.

(2001) Analyt. Biochem., 292, 155-160.

Use of hybridization and PCR-on-chip on specially developed TB-chips for identification of Mycobacterium tuberculosis strains resistant to rifampicin

Mikhailovich V., Lapa S., Gryadunov D., Strizhkov B., Sobolev A.,., Scotnikova O., Irtuganova O., Moroz A., Litvinov V., Shipina L., Vladimirskiy M.,, Chernousova L., Erokhin V. & Mirzabekov A.

(2001) Bull. Exper. Biology & Medicine (Russ.), 131, 1, 112-117

Identification of rifampin resistant Mycobacterium tuberculosis strains by hybridization, PCR, and ligase detection reaction on oligonucleotide microchips

Mikhailovich V., Lapa S., Gryadunov D., Sobolev A., Strizhkov B., Chernych N., Skotnikova O., Irtuganova O., Moroz A., Litvinov V., Vladimirskiy M., Perelman M., Chernousova L., Erokhin V., Zasedatelev A., & Mirzabekov A.

(2001) J. Clinical Microbiology, 39, 2531-2540

Binding specificity and stability of duplexes formed by modified oligonucleotides with a 4,096-hexanucleotide microarray.

Timofeev, E. & Mirzabekov, A.

(2001) Nucl. Acids Res. 29 (12), 2626-2634

Gel Immobilized Microarrays of Nucleic Acids and Proteins

Zlatanova, J. & Mirzabekov, A.

(2001) In Methods in Molecular Biology DNA Arrays Methods and Protocols, Rampal, J. B. (ed.), Ch. 2., Human Press, Inc., Totowa, NJ,

Microbial identification: A portable system for sample preparation and oligonucleotide microarray hybridization.

Bavykin, S.G., Akowski, J.P., Zakhariev, V.M., Barsky, V.E., & Mirzabekov, A.D.

(2001) Appl. & Environ. Microbiology, 67, 922-928

¤2000

Targeting of Pu.Py duplexes by GA and GT rich oligonucleotides on microchip and in solution.

Khomyakova, E., Liquier, J., Huynh-Dinh, T., Florentiev, V., & Mirzabekov, A.

(2000) J. Biomol. Structure & Dynamics. Conversation 11, No2, 227-235.

Sequencing by hybridization with the generic 6-mer oligonucleotide microarray: an advanced scheme for data processing.

Chechetkin, V.R., Turygin, A.Y., Proudnikov, D.Y., Prokopenko, D.V., Kirillov, Eu.V., & Mirzabekov, A.D.

(2000) J. Biomol. Structure & Dynamics 18, 83-101.

Sequencing by hybridization with the generic 6-mer oligonucleotide microarray: an advanced scheme for data processing.

Chechetkin, V.R., Turygin, A.Y., Proudnikov, D.Y., Prokopenko, D.V., Kirillov, Eu.V., & Mirzabekov, A.D.

(2000) J. Biomol. Structure & Dynamics 18, 83-101.

Detection of single nucleotide polymorphisms of the human mu opioid receptor gene by hybridization or single nucleotide extension

K.S. LaForge, V. Shick, R.Spangler, D.Proudnikov, V.Yuferov, Yu.Lysov, A.Mirzabekov, & M.J. Kreek

(2000) American Journal of Medical Genetics, Neuropsyciatric Genetics Section

Analysis of mutations in oral poliovirus vaccine by hybridization with generic oligonucleotide microchips.

Proudnikov D., Kirillov Eu., Chumakov K., Donlon J., Rezapkin G. & Mirzabekov A.

(2000) Biologicals, 28, 57-66

DNA sequence analysis by hybridization with oligonucleotide microchips: MALDI mass spectrometry identiofication of 5-mers contiguously stacked to microchip oligonucleotides

A. Stomakhin, V.Vasiliskov, E. Timofeev, D.Schulga, R. Cotter, & A. Mirzabekov

(2000) Nucl. Acids Res. 28 (5), 1193-1198

Advanced method for oligonucleotide deprotection

Surzhikov, S., Timofeev, E., Chernov, B., Golova, Yu., & Mirzabekov A.

(2000) Nucl. Acids Res. 28 (8), e29

Взаимное влияние олигонуклеотидов и флуоресцентной метки на эффективность гибридизации с олигонуклеотидами, иммобилизованными на биологических микрочипах.

Koтова, E., Kрейндлин Э., Барский В. и Mирзабеков, A.

(2000) Мол. Биол. 34, 237-245

Effects of various fluorochromes and competition between labeled oligonucleotides on their hybridization to oligonucleotides immobilized on biological microchips.

Kotova, E.Yu., Kreindlin E.Ya., Barsky, V.E. & Mirzabekov, A.D.

(2000) Mol. Biology (English Edition) 34, 207-214

Optical properties of fluorochromes promising for use in biological microchips.

Kotova, E.Yu., Kreindlin E.Ya., Barsky, V.E. & Mirzabekov, A.D.

(2000) Mol. Biology (English Edition) 34, 266-271

PCR amplification on a microarray of gel-immobilized oligonucleotides: Detection of bacterial toxin- and drug-resistant genes and their mutations.

Strizhkov, B.N., Drobyshev, A.L., Mikhailovich, V.M., & Mirzabekov, A.D.

(2000) BioTechniques 29, No4, 844-857

Protein microchips: Use for immunoassay and enzymatic reactions.

Arenkov, P., Kukhtin, A., Gemmell, A., Chupeeva, V., Voloschuk, S., & Mirzabekov, A.

(2000) Anal. Biochem. 278, 123-131

¤обзоры

Биочипы для медицинской диагностики

В.Р.Чечеткин, Д.В.Прокопенко, А.А.Макаров, А.С.Заседателев

(2006) Российские нанотехнологии, том 1, ? 1,2

Микрочипы на основе трехмерных ячеек геля: история и перспективы.

(2004) Мол. Биол., Т. 38, 5-16.

Biological microchips with hydrogel-immobilized nucleic acids, proteins, and other compounds: properties and applications in genomics.

Barsky V. E., Kolchinsky A. M., Lysov Yu. P., and Mirzabekov, A. D.

(2002) Mol. Biol. (Russ.) 36, 437-455.

Analysis of SNPs and other genomic variations using gel-based chips.

Kolchinsky, A. and Mirzabekov, A.

(2002) Hum. Mutat. 19, 343-360.

MAGIChip: Properties and Applications in Genomic Studies.

Mirzabekov, A. and Kolchinsky, A.

In: Genomic Technologies: Present and Future, v. 1 Eds. D. Galas and S. McCormack (2002). Horizon Scientific Press, Norfolk, UK, Chapter 6.

Emerging array-based technologies in proteomics.

Mirzabekov, A. and Kolchinsky, A.

(2001) Current Opinion in Chem. Biol. 6, 70-75.

Advances in the analysis of DNA sequence variations using oligonucleotide microchip technology.

Tillib S. and Mirzabekov A.

(2001) Curr. Opin. Biotechnol. 12, 53-58.

Gel-immobilized arrays of nucleic acids and proteins.

Zlatanova, J. and Mirzabekov, A.

(2001) In: Methods in Molecular Biology, v. 170. DNA Arrays, Methods and Protocols. Ed. Rampal, J. B. (2001) Humana Press, Totowa, NJ (2001), pp. 17-38.

¤главы из монографий

Metabolizing gene polymorphism analysis and susceptibility to lymphoproliferative diseases in Russian population.

Nasedkina T.V., Gra O.A., Kozhekbaeva Zh.M., Zasedatelev A.S.

(2008), Chapter IX in book: Population Genetics Research Progress. Editor: V. T. Koven. Nova Science Publishers, Inc. p.245-277.

Применение матричных биочипов с иммобилизованной ДНК в биологии и медицине.

Мирзабеков А., Прокопенко Д., Чечеткин В.

MAGIChip: Properties and applications in genomic studies.

Mirzabekov A., Kolchinsky A.

(2002) In: Genomic Technologies: Present and Future, Functional Genomics Series, vol. 1, Chapter 6. Eds. D. J. Galas , S. J. McCormack. Caister Academic Press, 163-196.

Методы для идентификации мутаций

О.И. Скотникова, А.С. Заседателев, В.М. Михайлович, А. Ю., Соболев, Д. А. Грядунов, Е. Л. Исаева, С.А. Лапа.

(2002) Под редакцией В.И.Литвинова, А.М.Мороза. Глава в монографии 'Лабораторная диагностика туберкулеза', МНПЦБТ, стр. 91-115.

¤ранние публикации

1988

A new method to determine the nucleotide sequence by hybridizing DNA with oligonucleotides.

Lysov, Yu., Florentiev, V., Khorlin, A., Khrapko, K., Shick, V. & Mirzabekov, A.

(1988) Proc. Acad. Sci. USSR, 303, 1508-1511.

1989

An oligonucleotide hybridization approach to DNA sequencing.

Khrapko, K., Lysov, Yu., Khorlin, A., Shick, V., Florentiev, V. & Mirzabekov, A.

(1989) FEBS Letters 256, 118-122.

1990

DNA sequencing by oligonucleotide hybridization.

Lysov, Yu., Khrapko, K., Chernyi, A., Khorlin, A., Florentiev, V. & Mirzabekov, A.

Proc. of the April 10-13, 1990 Conf. on Electrophoresis, Supercomputing and the Human Genome, Eds. Ch.Cantor & H.Lim (1991), pp. 157-163.

1991

A method for DNA sequencing by hybridization with oligonucleotide matrix.

Khrapko, K., Lysov, Yu., Khorlin, A., Ivanov, I., Yershov, G., Vasilenko, S., Florentiev, V. & Mirzabekov, A.

(1991) DNA Sequence 1, 375-388.

Pevzner, P., Lysov, Yu., Khrapko, K., Belyavsky, A., Florentiev, V. & Mirzabekov, A.

Improved chips for sequencing by hybridization.

(1991) J. Biomol. Structure & Dynamics 9, 399-410.

Hybridization properties of gel-immobilized oligonucleotides.

Ivanov, I., Khrapko, K., Chernov, B., Khorlin, A., Lysov, Yu., Florentiev, V. & Mirzabekov, A.

(1991) Nucl. Acids Res., Symp. ser., N 24, 189-190.

An oligonucleotide matrix hybridization approach to DNA sequencing.

Khorlin, A., Khrapko, K., Ivanov, I., Lysov, Yu., Yershov, G., Vasilenko, S., Florentiev, V. & Mirzabekov, A.

(1991) Nucl. Acids Res., Symp. ser., N 24, 191-192.

Report on the Sequencing by Hybridization Workshop.

Cantor, C., Mirzabekov, A. & Southern, E.

(1991) Genomics 13, 1378-1383.

Optimal chips for megabase sequencing of DNA

Pevzner, P., Lysov, Yu., Khrapko, K., Belyavsky, A., Florentiev, V. & Mirzabekov, A.

(1991) Mol. Biol. (Russ.) 25, 552-562.

Hybridization of DNA with oligonucleotides immobilized in gel: A convenient method for detection of single-base changes.

Khrapko, K., Chernov, B., Ivanov, I., Khorlin, A., Lysov, Y., Florentiev, V. & Mirzabekov, A.

(1991) Mol. Biol. (Russ), 25, 718-730.

1993

Реконструкция секвенируемой последовательности по результатам гибридизации встык с олигонуклеотидной матрицей

Лысов, Ю., Черный А., Балаев А., Битти К., Флорентьев В. и Мирзабеков А.

(1993) Moл. Биол., 27, 1126-1138.

1994

DNA sequencing by hybridization- a megasequencing method and a diagnostic tool?

Mirzabekov, A.

(1994) Trends in Biotechnology 12, 27-32.

Dissociation of duplexes formed by hybridization of DNA with gel-immobilized oligonucleotides

Livshits, M., Florentiev, V. & Mirzabekov, A.

(1994) J. Biomol. Structure & Dynamics 11, 783-795.

DNA sequencing by hybridization to oligonucleotide matrix. Calculation of continuous stacking hybridization efficiency.

Lysov, Yu., Chernyi, A., Balaeff, A., Beattie, K. & Mirzabekov, A.

(1994) J. Biomol. Structure & Dynamics 11, 797-812.

Секвенирование ДНК гибридизацией с олигонуклеотидами, иммобилизованными в геле. Химическое лигирование как способ расширения возможностей метода.

Кузнецова, С., Kaневский, И. , Флорентьев, В., Мирзабеков, A., и Шабарова З.

(1994) Moл. Биол. 28, 190-195 290-299

DNA sequencing by hybridization with gel-immobilized oligonucleotides: Expanding applicability with chemical ligation.

Kuznetsova, S., Kanevski ,I. , Florentiev, V., Mirzabekov, A., & Shabarova Z.

(1994) Molecular Biology (Russia) 28, 190-195 (English edition)

1996

Efficiency of sequencing by hybridization on oligonucleotide matrix supplemented by measurement of the distance between DNA segments.

Lysov, Yu., Gnuchev, F., Mironov, A., Chernyi, A., Beattie, K. & Mirzabekov, A.

(1996) DNA Sequence 6, 65-73.

Partial thermodynamic parameters for prediction of stabilities and washing behavior of DNA duplexes immobilized on gel matrix.

Kunitzin, A., Kochetkova, S., Timofeev, E. & Florentiev, V.

(1996) J. Biomol. Structure & Dynamics 14, 239-244.

DNA analysis and diagnostics on oligonucleotide microchips.

Yershov, G., Barsky, V., Belgovskiy, A., Kirillov, Eu., Kreindlin, E., Ivanov, I., Parinov, S., Guschin, D., Drobishev, A., Dubiley, S. & Mirzabekov, A.

(1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 4913-4918.

DNA sequencing by hybridization to microchip octa- and decanucleotides extended by stacked pentanucleotides.

Parinov, S., Barsky, V., Yershov, G., Kirillov, Eu., Timofeev, E., Belgovskiy, A. & Mirzabekov, A.

(1996) Nucl. Acids Res. 24, 2998-3004.

Regioselective immobilization of short oligonucleotides to acrylic copolymer gels.

Timofeev, E., Kochetkova, S., Mirzabekov, A. & Florentiev, V.

(1996) Nucl. Acids Res. 24, 3142-3148.

Methidium intercalator inserted into synthetic oligonucleotides.

Timofeev, E., Smirnov, I., Haff, L., Tishchenko, E., Mirzabekov, A. & Florentiev, V.

(1996) Tetrahedron Letters 37, 8467-8470.

Theoretical analysis of the kinetics of DNA hybridization with gel-immobilized oligonucleotides.

Livshits, M. & Mirzabekov, A.

(1996) Biophys. J. 71, 2795-2801.

Chemical methods of DNA and RNA fluorescent labeling.

Proudnikov, D. & Mirzabekov, A.

(1996) Nucl. Acids Res. 24, 4535-4542.

1997

Sequence analysis by hybridization with oligonucleotide microchip: identification of beta-thalassemia mutations.

Drobyshev, A., Mologina, N., Shick, V., Pobedimskaya, D., Yershov, G. & Mirzabekov, A.

(1997) Gene 188, 45-52.

Oligonucleotide microchips as genosensors for determinative and environmental studies in microbiology.

Guschin, D., Mobarry, B., Proudnikov, D., Stahl, D., Rittmann, B. & Mirzabekov, A.

(1997) Applied and Environmental Microbiology 63, 2397-2402.

Manual manufacturing of oligonucleotide, DNA and protein microchips.

Guschin, D., Yershov, G., Zaslavsky, A., Gemmell, A., Shick, V., Proudnikov, D., Arenkov, P. & Mirzabekov, A.

(1997) Anal. Biochem. 250, 203-211.

Fractionation, phosphorylation, and ligation on oligonucleotide microchips to enhance sequencing by hybridization.

Dubiley S., Kirillov, Eu., Lysov, Yu. & Mirzabekov, A.

(1997) Nucl. Acids Res. 25, 2259-2265.

Диагностика генетических мутаций на олигонуклеотидных микрочипах.

Иванов, И., Ершов Г., Барский, В., Бельговский, А., Кириллов, Е., Крейндлин, Э., Паринов, С., Мологина, Н., и Мирзабеков , А.

(1997) Мол. Биол., 31, 159-167.

1998

Parallel thermodynamic analysis of duplexes on oligodeoxyribonucleotide microchips.

Fotin, A., Drobyshev, A., Proudnikov, D., Perov, A., Mirzabekov, A.

(1998) Nucl. Acids Res. 26, 1515-1521.

Immobilization of DNA in polyacrylamide gel for the manufacture of DNA and DNA-oligonucleotide microchips.

Proudnikov, D., Timofeev, E., Mirzabekov, A.

(1998) Analyt. Biochem. 259, 34-41.

Identification of HLA DQA1 alleles by the oligonucleotide microchip method

Shick,V., Lebed, Yu., & Kryukov, G.

(1998) Molecular Biology 32, 679-688 (English edition)

Wide-field luminescence microscopes for analyzing biological microchips.

Barsky, Ya., Grammatin, A., Ivanov, A., Kreindlin, E., Kotova, E., Barskii, V., Mirzabekov, A.

(1998) J. Opt. Technol. 65 (11), 938-941

1999

Fabrication of microarray of gel-immobilized compounds on a chip by copolymerization.

A. Vasiliskov, V., Timofeev E., Surzhikov S., Drobyshev, A., Shick, V., Mirzabekov, A.

(1999) BioTechnique 27, 592-606

Polymorphism analysis and gene detection by minisequencing on an array of gel-immobilized primers.

B. Dubiley, S., Kirillov, Eu., & Mirzabekov, A.

(1999) Nucl. Acids Res. 27, e19

Massive parallel analysis of DNA-Hoechst 33258 binding specificity with a generic oligodeoxyribonucleotide microchip

C. Drobyshev A., Zasedatelev A., Yershov G. & Mirzabekov A.

(1999) Nucl. Acids Res. 27, 4100-4105


		Институт Молекулярной Биологии им. В.А.Энгельгардта Российской Академии Наук ул. Вавилова 32, Москва 119991 Тел. (+7499) 135-05-59 www.eimb.ru, info@biochip.ru