|
|
о лаборатории
ВЕДУЩИЕ НАПРАВЛЕНИЯ И РУКОВОДИТЕЛИ:
|
Зав. Лабораторией
д.ф.-м.н., профессор Заседателев Александр Сергеевич
(Является также: - зам.директора ИМБ РАН и Зав. Кафедрой молекулярной биофизики МФТИ)
тел.: 8(499)135-9800
|
|
|
|
Зам. Зав. Лабораторией
д.б.н. Михайлович Владимир Михайлович
тел.: 8(499)135-1177
|
|
|
Руководитель Группы анализа патогенных бактерий и вирусов
к.б.н. Грядунов Дмитрий Александрович.
тел.: 8(499)135-98-46
|
|
|
|
Руководитель Группы анализа генома человека
д.б.н. Наседкина Татьяна Васильевна
тел.: 8(499)135-62-59
|
|
|
Руководитель Группы белковых биочипов
к.х.н. Рубина Алла Юрьевна тел. 8(499)135-99-80
|
|
НАПРАВЛЕНИЯ ИССЛЕДОВАНИЙ:
Основные направления фундаментальных и прикладных исследований
- Изучение структуры и функций биомолекул и биомолекулярных комплексов:
- исследование специфичности ДНК-ДНК, ДНК-лиганд и ДНК-белковых взаимодействий с помощью универсальных ("generic") биочипов, содержащих полный набор всех возможных последовательностей гексануклеотидов и позволяющих проводить многопараметрический анализ термодинамических параметров связывания;
- исследование специфичности белок-НК, белок-лиганд и белок-белковых взаимодействий с помощью белковых биочипов, позволяющих проводить многопараметрический анализ термодинамических параметров связывания;
- анализ геномов патогенных бактерий и вирусов, а также определение их чувствительности к действию лекарственных соединений с помощью биологических микрочипов;
- исследование процессов диффузии и гибридизации в гелях молекул ДНК, белков или их фрагментов, способных образовывать специфичные комплексы с гель-иммобилизованными олигонуклеотидами или молекулами белков.
- Анализ механизмов реализации генетической информации:
- анализ полиморфизма генома человека и мутаций, определяющих предрасположенность к некоторым онкологическим или наследственным заболеваниям, а также индивидуальную чувствительность к определенным типам лекарственной терапии.
- Разработка биочипов для фундаментальных исследований:
- создание универсальных ("generic") биочипов, содержащих в 4096 ячейках полный набор всех возможных последовательностей гексануклеотидов, для многопараметрического анализа термодинамических параметров, характеризующих специфичность ДНК-ДНК, ДНК-лиганд и ДНК-белковых взаимодействий;
- разработка белковых и гликановых биочипов для многопараметрического анализа термодинамических параметров, характеризующих специфичность белок-НК, белок-лиганд, белок-белковых и белок-гликановых взаимодействий;
- Разработка биочипов для медицинской диагностики и формирования баз данных ДНК:
- разработка олигонуклеотидных биочипов для обнаружения и генотипирования патогенных бактерий и вирусов и анализа их лекарственной устойчивости;
- разработка олигонуклеотидных биочипов для анализа генетической предрасположенности к определенным онкологическим или наследственным заболеваниям, а также индивидуальную чувствительность к некоторым типам лекарственной терапии;
- разработка биочипов для типирования хромосомных перестроек и мутаций при онкологических заболеваниях;
- разработка белковых биочипов для количественного анализа белковых онкомаркеров в сыворотке крови;
- разработка белковых биочипов для выявления и количественного анализа растительных и бактериальных биотоксинов;
- разработка биочипов для генетической идентификации личности при проведении судебно-генетических экспертиз и формирования баз данных ДНК;
- Создание приборно-аналитической базы технологии биочипов:
- разработка анализаторов биочипов и необходимого программного обеспечения для применения биочипов в фундаментальных исследованиях и медицинской диагностике;
- разработка автоматизированного устройства на основе сменных картриджей для выделения микроколичеств нуклеиновых кислот из биологических образцов;
- Разработка средств массового производства биочипов:
- создание опытного производства для изготовления биочипов и тест-систем на их основе для последующей сертификации и использования в медицинской диагностике;
- выполнение ОКР по инновационному проекту государственного значения 'Развитие и массовое применение новых технологий диагностики социально-значимых заболеваний на основе молекулярных методов многопараметрического анализа';
- Обучение и передача технологии биочипов заинтересованным организациям научного и медицинского профиля:
- обеспечение выполнения работ научного и прикладного характера для заинтересованных институтов РАН, РАМН, учреждений медицинского профиля и ряда других организаций на базе созданного при Лаборатории биологических микрочипов Центра коллективного пользования технологией биологических микрочипов.
Важнейшие достижения Лаборатории за последние 10 лет
- Создан универсальный биочип, содержащий в 4096 ячейках полный перебор всех гексадезоксирибонуклеотидных последовательностей. С помощью этого биочипа определена сиквенс-специфичность связывания регуляторных белков HU-8, p50, λ-Cro V55C, а также флуоресцентного красителя Хехст-33258 со всеми гексануклеотидными последовательностями ДНК.
- Разработана технология белковых биочипов, позволяющая проводить многопараметрический анализ специфичности белок-белковых и белок-лигандных взаимодействий. Показано, что молекулы белков, включая ферменты, сохраняют свою биологическую активность при иммобилизации в гелевых ячейках биочипа.
- Разработан метод проведения ПЦР в ячейках биочипа в режиме реального времени.
- Разработана, запатентована и внедряется в медицинскую диагностику нанотехнология биочипов, которая позволяет проводить оперативный анализ социально значимых инфекционных, онкологических, сердечно-сосудистых и наследственных заболеваний, а также выявлять особо опасные инфекции и биотоксины.
Технология биочипов позволяет идентифицировать:
- возбудитель ТУБЕРКУЛЕЗА и его лекарственно-устойчивые формы (время анализа составляет 18 часов вместо 6-10 недель в настоящее время, метод не имеет аналогов и нашел широкое применение в противотуберкулезных центрах России, зарегистрирован для медицинского применения в РФ),
- хромосомные транслокации (8 типов) при ЛЕЙКОЗАХ (метод применяется в России, находится на испытаниях в США и Бразилии, зарегистрирован для медицинского применения в РФ),
- генетическую предрасположенность к определенным онкологическим или наследственным заболеваниям, а также индивидуальную чувствительность к некоторым типам терапии,
- возбудителей ВИЧ, гепатитов В и С (22 подтипа),
- возбудителей ОСПЫ, оспы животных (8 типов), ветряной оспы, простого герпеса (2 типа),
- возбудителей СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ,
- белковые маркеры ОНКОЗАБОЛЕВАНИЙ,
- наличие определенных БИОТОКСИНОВ (16 типов),
- возбудителей инфекций новорожденных,
- вирус возбудителя ГРИППА А (30 подтипов), включая птичий грипп H5N1,
- генетическую индивидуальность личности при проведении судебно-медицинских экспертиз и формировании баз данных ДНК.
|
|
|