ПФ-БИОЧИП
Тест-система «ПФ-БИОЧИП» используется для выявления и диагностики генетической предрасположенности к развитию онкологических заболеваний различной этиологии и для определения индивидуальной чувствительности к некоторым лекарственным препаратам (5-фторурацилу, метотрексату, омепразолу и др.)
«Фармакогенетический» биочип (ПФ-БИОЧИП), разработанный в 2004 году, является базовой молекулярно-диагностической платформой для изучения генетической предрасположенности к некоторым онкологическим заболеваниям, а также для определения индивидуальной чувствительности к ряду лекарственных препаратов. В зависимости от конкретной исследовательской или диагностической задачи (например, в зависимости от формы изучаемого заболевания) биочип может быть легко модифицирован.
С помощью разработанного нами биочипа на гены системы биотрансформации можно не только анализировать генетическую предрасположенность к раку легкого, лейкозам, лимфомам, эпилепсии, эндометриозу, псориазу и многим другим заболеваниям, но и использовать, полученные с его помощью результаты для коррекции дозы лекарственных препаратов, а также использовать при создании «генетического паспорта».
Сравнение со стандартными методами
Показатели |
ПДРФ |
REAL-TIME ПЦР |
Анализ, проводимый с помощью биочипов |
Преимущества |
Средняя точность. Низкая себестоимость. |
Высокая точность и воспроизводимость. Длительность анализа около 2-х часов.
|
Высокая точность и воспроизводимость. Низкая себестоимость. Возможность мультиплексности. |
Недостатки |
Длительность анализа 5-24 часов. Отсутствие мультиплексности.
|
Отсутствие мультиплексности. Высокая себестоимость.
|
Длительность анализа 9-18 часов. |
|
Порядок проведения анализа с использованием тест-системы «ПФ-БИОЧИП»
- выделение ДНК из крови, слюны или другого клинического материала;
- проведение двух-раундовой полимеразной цепной реакции;
- гибридизация ПЦР-продукта с олигонуклеотидным биочипом;
- анализ результатов гибридизации с помощью портативного анализатора биочипов.
Чувствительность и специфичность тест-системы
Чувствительность метода составляет 10 нг, то есть в реакцию на первом этапе необходимо вносить не менее 10 нг геномной ДНК.
ПФ-БИОЧИП был протестирован на 25 контрольных и более 1100 диагностических образцах. В контрольных образцах мутации были определены ранее с помощью двух других методов: ПДРФ-анализа и секвенирования. Сравнение данных рестрикционного анализа, секвенирования и гибридизации на микрочипе показало полное совпадение результатов.
Отчеты в специализированной программе ImageWare
Состав тест-системы «ПФ-БИОЧИП»
|
фото коробки с чипами тест-системы «ПФ-БИОЧИП» |
|